境内年降水量1200～2100毫米，多年平均降水量为1673.9毫米。其中上街镇土溪雨量站年均降雨量为2152.6毫米，南屿镇葛岐雨量站年均降雨量为1258.9毫米。各地降水量分布不均，北部和西南部中山地区，海拔900～1200米，形成一个多雨层，年平均降水量为1700～2000毫米；中部丘陵地区，年平均降水量为1500～1700毫米；闽江沿岸平原区，年平均降水量1300～1500毫米。上街、大湖为全县两个降水中心。上街极端最大年降水量曾达到2850毫米(1961年土溪站)；大湖的雪峰站平均降水量为1954毫米。南屿、祥谦是本县降水量最少的地区，多年平均降水量为1332毫米。

　　全县年平均雨日150天，占全年日数41.8%，晴天42天，占11.5%。一年中，降水量多集中在3～6月份，尤以5～6月为多。根据降水变化特征和成因，全年可分为4个降水季节：

　　春雨季(2～4月)　降水量约290～420毫米，占全年的22%。其特点是雨日多，雨量少，出现阴雨低温，降水强度弱。

　　梅雨季(5～6月)　降雨量在400～580毫米之间，约占全年的30%，6月份为全年降水高峰期，约210～310毫米，占全年的16%。其特点是雨时长，范围广，雨量多，强度大，常出现大雨到暴雨，造成洪涝灾害。

　　台风、雷雨季(7～9月)　雨量分布不均，降水量在500.6毫米左右，约占全年的36%。其特点是降水年际变幅大，受台风影响，时常出现暴雨，炎热天气常出现午后雷阵雨。多雨年份易发生洪涝灾害，少雨年份易出现干旱。

　　少雨季(10月至翌年1月)　降水量在140～330毫米，占全年12%。其特点是雨日少，降水量小，晴好天气多，经常是干冷天气。

　　境内年平均绝对湿度为19.7毫巴，平原地区在18～20毫巴之间，山区在16～17毫巴左右，随着高度的增加而减小，极端最大绝对湿度40.7毫巴(1967年7月19日)，极端最低绝对湿度20毫巴(1963年1月27日)。一年中绝对湿度的季节变化趋势与气温相同，1月最小，月平均值在9.7毫巴；7月最大，月平均值31.4毫巴。日变化情况是：凌晨(4～6时)绝对湿度最小，最大值出现在13～14时。

　　相对湿度分布，平原地区年平均在75%～80%之间，高山地区在81%～85%之间。分布趋势与气温相反，随高度增加而增大。一年中最大的月平均值出现在阴雨连绵空气湿润的5、6月份，其值高达84%～86%，最小值出现在1月为75%。日极端最小相对湿度仅为11%(1963年1月25日)。

　　境内年平均日照时数为1959小时，日平均5.1小时。一年中夏季日照时数最多，冬季最少；7月份平均日照时数达281小时，2月份仅98.7小时。境内的太阳总辐射为107.3千卡/厘米2·年，闽江两岸为109.7千卡/厘米2·年，北部高海拔地区为103.7千卡/厘米2·年，随海拔高度的增加而减少。日照的年际变幅度较大，1963年最多，达2524.6小时；1954年最少，仅1179.4小时。